フッ化水素酸が皮膚にかかることによりおこる化学熱傷では、表面だけでなくフッ化水素が体内組織に深く浸入し、重篤な症状を示すことがあります。特にかかった部位が広いと皮膚から吸収された後に体内のカルシウムとフッ化水素反応し、急性カルシウム血症により致命的な全身障害（低カルシウム血症により心室細動を起こし心停止に至る）をおこすこともあります。かかった直後には自覚症状がなくても、皮膚から浸入したフッ化水素酸が骨に達し、数時間後に痛み始めることもあります。このような理由により、たとえ希薄でもフッ化水素酸から発生するフッ化水素ガスを吸入したり、フッ化水素酸に接触したりすることのないよう、格段の注意が必要です。